Une variante « recombinante » a émergé, baptisée « Omicron XE », qui est le résultat de la fusion de deux souches d’omicron dans un seul hôte, puis en infecte d’autres.

Alors que sait-on de ce nouvel hybride ? Doit-on s’inquiéter ?

Un peu sur Omicron et ses variantes

Omicron est une variante du virus SARS-CoV-2 qui a été découverte pour la première fois au Botswana le 11 novembre 2021 et désignée comme variante préoccupante par l’OMS le 26 novembre. Depuis lors, il a été diffusé dans le monde entier et a remplacé Delta pour devenir la variante dominante.

Depuis lors, Omicron a continué d’évoluer pour avoir plusieurs lignées ou sous-variantes différentes génétiquement liées. Cela inclut l’original Omicron BA.1 (B.1.1.529) ainsi que BA.2 et BA.3.

BA.2 est plus infectieux que BA.1 et a maintenant pris le relais ou dépassé BA.1 pour devenir la nouvelle forme dominante du virus SARS-CoV-2 dans le monde, et l’OMS a officiellement annoncé que ce sera le cas le 22 mars , 2022.

Les différences que nous avons observées avec Omicron par rapport aux variantes précédentes s’expliquent par le nombre relativement important de mutations qu’il a acquises, avec 60 mutations non trouvées dans le virus d’origine émergeant de Wuhan, en Chine.

Parmi ces mutations, il y a 32 changements génétiques dans la protéine de pointe. La protéine de pointe est la partie du virus qu’elle utilise pour se fixer aux cellules humaines, ainsi que la cible de la réponse immunitaire contre le virus, à la fois des vaccins et d’une infection antérieure.

BA.2 partage bon nombre de ces mêmes mutations que la variante originale d’Omicron, mais possède également 28 modifications génétiques uniques. Quatre de ces modifications génétiques concernent la protéine de pointe, ce qui explique pourquoi certaines de ses caractéristiques sont différentes de la variante originale d’Omicron (BA.1), notamment le fait qu’elle semble être environ 30 à 50 % plus infectieuse que BA. 1.

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Qu’est-ce qu’un « recombinant » ?

Tout comme nous avons vu émerger de nouvelles variantes, suivies de l’évolution de sous-variantes ou de différentes lignées, le virus SARS-CoV-2 a également continué à changer d’autres manières. Ces derniers temps, nous avons vu non seulement des changements spontanés dans le code génétique qui ont expliqué les changements décrits ci-dessus, mais aussi les soi-disant recombinants.

Un recombinant est l’endroit où des virus apparentés échangent du matériel génétique pour créer une progéniture avec du matériel génétique des deux virus parents. Cela peut survenir lorsque des virus de deux souches différentes (ou variantes ou sous-variantes) co-infectent la même cellule.

Le matériel génétique des virus peut être mélangé et emballé pour former un nouveau virus recombinant, avec les propriétés de l’un ou des deux virus d’origine. Les propriétés du virus recombinant dépendent donc des parties du matériel génétique des virus originaux qui deviennent la nouvelle version, tout comme vous pourriez avoir le nez de votre mère et les genoux de votre père.

Lorsque Delta et Omicron sont recombinés, la progéniture résultante est connue sous le nom de « Deltacron » (bien que plus officiellement, elle soit connue sous le nom de XD et XF). Ce type de recombinant a été identifié pour la première fois en France à la mi-février et semble avoir une origine génétique. la séquence est presque la même que celle de Delta, mais avec des aspects de la protéine de pointe Omicron BA.1.

Alors, qu’est-ce que XE et où se propage-t-il ?

XE est une recombinaison de BA.1 et BA.2. Il existe de nombreux autres recombinants BA.1 et BA.2, notamment XQ au Royaume-Uni, XG au Danemark, XJ en Finlande et XK en Belgique.

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Alors que XE comprend encore une petite proportion du nombre total de cas séquencés, il a montré des preuves de transmission communautaire, du moins en Angleterre, où il a été détecté pour la première fois à la mi-janvier. Un peu plus de 1 100 cas ont été enregistrés à ce jour.

Il a également été identifié en Inde, en Chine et en Thaïlande. Au départ, le taux de croissance de XE ne semblait pas significativement différent de celui de BA.2, mais des données plus récentes du Royaume-Uni suggèrent qu’il a un taux de croissance d’environ 10 à 20 % supérieur à celui de BA.2.

Ces données sont encore préliminaires et basées sur de petits nombres, elles peuvent donc changer à mesure que nous obtenons plus d’informations. Si c’est vrai, cela signifie que XE est susceptible d’être légèrement plus contagieux que BA.2, qui était légèrement plus contagieux que BA.1, qui était plus contagieux que Delta.

Doit-on s’inquiéter ?

Notre réponse immunitaire qui aide à protéger contre le COVID-19 est générée par la vaccination ou une infection antérieure, et est principalement dirigée contre la protéine de pointe. Étant donné que XE a essentiellement la même protéine de pointe que BA.2, il ne semble pas que notre protection contre XE soit significativement réduite.

Bien que ce soit quelque chose que les agences de santé publique et les groupes de réflexion devraient certainement surveiller et faire, ce n’est pas vraiment inattendu étant donné le nombre de cas que nous continuons à voir dans le monde. Par conséquent, cela ne devrait pas être une préoccupation supplémentaire pour le grand public.

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Le meilleur moyen d’arrêter l’émergence de nouveaux variants, ainsi que des recombinants, reste de protéger autant de personnes dans le monde par la vaccination afin de réduire le groupe d’hôtes sensibles chez lesquels ces événements peuvent survenir.

Cette histoire a été publiée à partir d’une source d’agence de presse sans modification du texte. Seul le titre a été modifié.

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