Un modèle de la protéine de pointe du nouveau coronavirus. Photo : NIAID/Flickr, CC BY 2.0


  • L’Institut Pasteur de Paris a annoncé avoir séquencé un génome qui semble être une combinaison de ceux des variants omicron et delta.
  • De tels variants recombinants ne seront pas nécessairement plus transmissibles ou plus létaux que l’un ou l’autre des deux variants « parents » ; C’est possible, mais ce n’est pas une règle.
  • La recombinaison ne se produit que lorsque deux variantes différentes pénètrent simultanément dans la même cellule du corps d’un individu. S’ils vont dans des cellules différentes, ils ne peuvent pas se recombiner.

New Delhi: En un peu plus de deux ans de pandémie, il y a eu cinq « variantes préoccupantes ». Maintenant, l’Institut Pasteur de Paris a annoncé avoir séquencé un génome qui semble être une combinaison de ceux des variantes omicron et delta.

En réponse au rapport, Jeremy Kamil, un virologue basé aux États-Unis, a tweeté un fil avec plus de détails le 8 mars.

La variante en question circulait en France depuis janvier 2022, selon le consortium de séquençage du génome du pays. En fait, le Danemark et les Pays-Bas avaient également signalé des génomes similaires dans des échantillons prélevés sur leurs populations.

L’OMS a maintenant pris note de la découverte de l’Institut Pasteur.

Il n’est pas courant que les génomes des nouvelles souches du nouveau coronavirus soient une combinaison de ceux d’autres variantes. Ces « mélanges » sont appelés recombinaisons. La recombinaison se produit lorsqu’une personne est infectée par deux variantes du même virus en même temps.

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Le variant recombinant résultant ne sera pas nécessairement plus transmissible ou plus létal que l’un ou l’autre des deux variants « parents ». C’est parce qu’il n’y a pas de règle selon laquelle seules les pires parties1 des variantes se recombinent. C’est évidemment possible, mais ce n’est pas une règle.

Deuxièmement, la recombinaison ne se produit que lorsque les deux variants entrent dans le même cellule dans le corps d’un individu. S’ils vont dans des cellules différentes, ils ne pourront pas se recombiner. C’est la raison pour laquelle les variants recombinants sont rares.

Cette exigence implique également une autre condition : les souches recombinantes ne peuvent apparaître que lorsque deux variants circulent en même temps. Par exemple, il fut un temps fin 2021 et début 2022 où la variante omicron se propageait rapidement, mais n’avait pas complètement déplacé la variante delta.

Troisièmement, une fois que les deux variants se sont recombinés, rien ne garantit que la souche recombinante se propagera dans la population. Cela ne peut se produire que si la personne (dont le corps abrite le recombinant) transmet les particules virales à une autre personne.

Lors d’une conférence de presse le 9 mars, la directrice technique COVID-19 de l’OMS, Maria Van Kerkhove, a déclaré que l’organisme était au courant du rapport de l’Institut Pasteur. Il a ajouté que la nouvelle souche recombinante était présente en France, au Danemark et aux Pays-Bas à « de très faibles niveaux ».

« Nous n’avons vu aucun changement dans l’épidémiologie avec ce recombinant, nous n’avons vu aucun changement dans la gravité, mais il y a beaucoup d’études en cours », a-t-il ajouté.

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Un scientifique travaillant dans une installation faisant partie du Consortium indien de génomique SARS-CoV-2, mieux connu sous le nom d’INSACOG, a déclaré que des scientifiques indiens avaient également précédemment enregistré un recombinant delta-omicron. (Il a souhaité rester anonyme car il n’était pas autorisé à parler à la presse.)

Une souche recombinante a également été signalée de Chypre.

Aussi rares soient-elles, les recombinaisons sont également naturelles. Cela s’est produit avec le virus de la grippe, par exemple, ainsi que parmi d’autres souches du nouveau coronavirus.

des scientifiques de La Chine a signalé une recombinaison des variantes bêta et delta le 20 janvier 2022. Dans Guinée équatorialeles scientifiques ont signalé une recombinaison de souches bêta et delta au cours du même mois, déclarant qu’il s’agissait du premier cas connu.

Un recombinant n’a de valeur de santé publique que lorsque sa transmission et la gravité de l’infection sont connues. Et jusqu’à présent, rien n’indique que le recombinant delta-micron nouvellement signalé soit plus transmissible ou plus mortel.

En fait, se concentrer sur le recombinant lui-même peut masquer la chose la plus importante ici : le Découverte de nouvelles souches recombinantes. Nous ne pouvons faire de telles découvertes que si nous ne baissons pas la garde, en particulier dans le séquençage et les tests du génome.

Comme l’a dit Kerkhove :

« Il est vraiment essentiel que nous ayons des tests et il est vraiment essentiel que nous ayons un séquençage, que nous ayons une bonne représentation géographique du séquençage dans le monde et que les systèmes qui ont été mis en place pour la surveillance, pour les tests, pour le séquençage en ce moment soient renforcés . , qu’ils ne sont pas désarmés.

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