Cette étude marque la première fois que des chercheurs séquencent des génomes végétaux à partir d’anciennes pousses.

Des chercheurs du Center for Genomics and Systems Biology de l’Université de New York à Abu Dhabi ont séquencé avec succès le génome de variétés de palmiers dattiers auparavant éteintes qui vivaient il y a plus de 2000 ans. Ils l’ont fait en utilisant des graines de palmier dattier qui ont été récupérées sur des sites archéologiques dans le sud de la région de Levante et du radiocarbone datant du 4ème siècle avant JC. Jusqu’au 2ème siècle après JC. C. Les graines ont germé pour produire de nouvelles plantes viables. Les chercheurs ont effectué un séquençage du génome entier de ces anciens échantillons germés et ont utilisé ces données génomiques pour examiner la génétique de ces palmiers dattiers de Judée auparavant disparus. Cette étude marque la première fois que des chercheurs séquencent des génomes végétaux à partir d’anciennes pousses.

En examinant le génome d’une espèce (Phoenix dactylifera L.) qui a prospéré il y a des siècles, le professeur de biologie Michael D.Purugganan et ses collègues du NYUAD, ainsi que des partenaires de recherche en Israël et en France, ont pu voir comment ces plantes ont évolué en cours de route. sur une période de temps. période de temps. Dans ce cas, ils ont observé qu’entre le 4ème siècle avant JC. C. et le deuxième siècle d. C., les palmiers dattiers de la Méditerranée orientale ont commencé à montrer des niveaux croissants de gènes d’une autre espèce, Phoenix theophrasti, qui pousse aujourd’hui en Crète et dans certaines autres îles grecques. comme le sud-ouest de la Turquie, en raison de l’hybridation inter-espèces. Ils concluent que l’augmentation du niveau génétique de P. theophrasti au cours de cette période montre l’influence croissante de l’Empire romain dans l’est de la Méditerranée.

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Methuselah

Un des palmiers dattiers qui a germé à partir d’une graine de 2200 ans, qui pousse maintenant en Israël. Crédits: Sarah Sallon

Leurs découvertes sont rapportées dans “Ancient Date Palm Genomes Germinated from 2,000-Year-Old Seeds” publié dans la revue. Actes de l’Académie nationale des sciences Etats-Unis

«Nous avons la chance que les graines de palmier dattier puissent vivre longtemps, dans ce cas plus de 2000 ans, et germer avec un minimum ADN dommages, dans l’environnement sec de la région », a déclaré Purugganan. «Cette approche de« génomique de la résurrection »est un moyen remarquablement efficace d’étudier la génétique et l’évolution des espèces passées et peut-être éteintes comme les palmiers dattiers de Judée. En ravivant du matériel biologique, tel que la germination de graines anciennes à partir de collections archéologiques, paléontologiques ou historiques, nous pouvons non seulement étudier les génomes des populations perdues, mais aussi, dans certains cas, redécouvrir des gènes qui peuvent avoir disparu dans les variétés modernes. “

Référence: «Les génomes des palmiers dattiers antiques ont germé à partir de graines vieilles de 2 000 ans» 3 mai 2021, Actes de l’Académie nationale des sciences.
DOI: 10.1073 / pnas.2025337118